批发市场是农产品最传统的流通渠道。水果相对蔬菜是比较耐存储的，但是水果却比蔬菜流通经过的环节少。究其原因，首先，水果价值相对高，不用太大的量来支撑运作成本。其次是水果耐存储，一次大批量购入可以慢慢消化。说到最有名气的批发市场，蔬菜在寿光，国产水果在嘉兴，进口水果则是在深圳和广州。
来自深圳海关的统计数据显示，2016年经深圳口岸进口水果103.3万吨，价值共计151.9亿元，均位居全国口岸第一位。春节期间，深圳生鲜进出口主要通道文锦渡口岸车来车往，满载樱桃、蓝莓、猕猴桃等进口水果的货柜车接连入境，将货物送往珠三角以及福建、江西、湖北和重庆等地的水果批发市场。
深圳关区进口水果的快速增长主要得益于我国与各国签订的自贸协定。据统计，2016年深圳关区进口各自贸协定项下水果88.2万吨，同比增长9.0％；受惠货值为135.2亿元，同比增长27.6％；税款优惠金额达23.2亿元，同比增长22.4％。水果受惠货值占同期全国水果受惠总值近5成，居全国第一位。
此外，广州江南市场是最大的进口水果集散地之一，靠近香港，政策宽松，又有大量台湾香港的水果贸易商云集，水果交易量大的惊人，全国各地大的水果经营商都从那进货。华东地区能整车销售的市场有上海辉展批发市场，但是和广州比不在一级数量级上。
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